كنيسة مار بطرس الأثرية عبارة عن مغارة تبلغ مساحتها 24 قدماً وارتفاعها لا يتجاوز 8 كيلومتراً.تتميز بمذبح على الطراز المسيحي الأرامي و11 ناووساً صخرياً منحوتاً بطول قامة الإنسان يقال بأنها أضرحة لكهنة معبد ادونيس، و3 أعمدة ضخمة تنضح الماء من وسطها.

كما يوجد على الجدار الشرقي داخل الكنيسة كتابة منقوشة باللغة الآرامية وتعد كنيسة مار بطرس اليوم بمثابة مزار ديني.